Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C5C9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C5C9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms