Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J6

Sowahc, Ankyrin repeat domain-containing protein SOWAHC, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SowahcQ8C0J6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SowahcQ8C0J6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms