Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ube3dQ8BX13 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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