Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Snx17Q8BVL3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Snx17Q8BVL3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Snx17Q8BVL3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Snx17Q8BVL3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Snx17Q8BVL3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Snx17Q8BVL3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Snx17Q8BVL3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Snx17Q8BVL3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx17Q8BVL3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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Snx17Q8BVL3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms