Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmd4aQ8BIE6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms