Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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