Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Usp8Q80U87 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp8Q80U87 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Usp8Q80U87 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp8Q80U87 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp8Q80U87 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp8Q80U87 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp8Q80U87 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp8Q80U87 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp8Q80U87 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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