Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms