Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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