Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snd1Q78PY7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms