Protein–RNA interactions for Protein: Q717B4

Tdpoz3, TD and POZ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdpoz3Q717B4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tdpoz3Q717B4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tdpoz3Q717B4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms