Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Kcnt1Q6ZPR4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Kcnt1Q6ZPR4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Kcnt1Q6ZPR4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Kcnt1Q6ZPR4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Kcnt1Q6ZPR4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Kcnt1Q6ZPR4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnt1Q6ZPR4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms