Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms