Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ0

Cd300a, CMRF35-like molecule 8, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300aQ6SJQ0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300aQ6SJQ0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms