Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms