Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm4Q6IRU2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm4Q6IRU2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms