Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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