Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Sv2cQ69ZS6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Sv2cQ69ZS6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Sv2cQ69ZS6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Sv2cQ69ZS6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Sv2cQ69ZS6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Sv2cQ69ZS6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Sv2cQ69ZS6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sv2cQ69ZS6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms