Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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