Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms