Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Zfp248Q640N4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Zfp248Q640N4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Zfp248Q640N4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Zfp248Q640N4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Zfp248Q640N4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Zfp248Q640N4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Zfp248Q640N4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Zfp248Q640N4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Zfp248Q640N4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Zfp248Q640N4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Zfp248Q640N4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Zfp248Q640N4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Zfp248Q640N4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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