Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms