Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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