Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stxbp3Q60770 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms