Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms