Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms