Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms