Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms