Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp3Q3ULW8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms