Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms