Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms