Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Nlrx1Q3TL44 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Nlrx1Q3TL44 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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Nlrx1Q3TL44 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Nlrx1Q3TL44 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Nlrx1Q3TL44 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Nlrx1Q3TL44 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Nlrx1Q3TL44 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Nlrx1Q3TL44 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Nlrx1Q3TL44 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Nlrx1Q3TL44 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Nlrx1Q3TL44 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Nlrx1Q3TL44 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms