Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cwc27Q3TKY6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms