Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms