Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms