Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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