Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Cnn1Q08091 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Cnn1Q08091 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms