Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms