Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Thbs3Q05895 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Thbs3Q05895 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Thbs3Q05895 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Thbs3Q05895 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Thbs3Q05895 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs3Q05895 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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