Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox9Q04887 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms