Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox8Q04886 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms