Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms