Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb5Q02739 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms