Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Gja5Q01231 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja5Q01231 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms