Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VegfaQ00731 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms