Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms