Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhodP97348 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RhodP97348 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhodP97348 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhodP97348 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhodP97348 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhodP97348 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhodP97348 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhodP97348 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhodP97348 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhodP97348 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhodP97348 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhodP97348 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhodP97348 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RhodP97348 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhodP97348 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhodP97348 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhodP97348 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms