Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cbx1P83917 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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