Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SgcgP82348 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SgcgP82348 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SgcgP82348 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgcgP82348 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgcgP82348 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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