Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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